Американские водяные спаниели обладают уникальной шерстью, состоящей из двух слоев: мягкого подшерстка, обеспечивающего теплоизоляцию, и верхнего слоя, состоящего из более грубых волос, которые отталкивают воду и помогают спаниелям охотиться на водных птиц. Весной собаки этой породы линяют, однако старая шерсть с легкостью удаляется при помощи расчесывания.
В среднем длина шерсти американского водяного спаниеля лишь на 1 сантиметр больше, чем у их близкого родственника - лабрадора-ретривера. Для поддержания шерсти в хорошем состоянии достаточно вычесывать собаку один раз в неделю.
Спаниелей, регулярно плавающих в открытой воде, следует купать чаще, чтобы у них не появлялся характерный неприятный запах мокрой псины.
Охотники иногда стригут своих спаниелей довольно коротко, чтобы с шерсти легче было счищать различные колючки. Также иногда хозяева смазывают шерсть своих питомцев маслом, так как после этого удалять колючки становится значительно проще.
