Однородный подбор не так прост, как может показаться на первый взгляд. Выдающиеся по своим качествам животные встречаются не столь часто. Сохранение их качеств в потомстве представляет большую трудность. Из-за «усреднения» генотипов потомков вследствие особенностей полового размножения наблюдается, как правило, явление регрессии, то есть возврата к средним показателям.

Благоприятная комбинация генов в случае их гетерозиготного состояния будет подвергаться расщеплению. Закрепление полезных признаков, которое Е. А. Богданов назвал консолидированием наследственности, может идти путем повышения гомозиготности и увеличения генетического сходства потомков с выдающимися предками. В обоих случаях в группе потомков будет наблюдаться процесс увеличения частот генов, носителями которых являлись выдающиеся предки, При этом важно сохранить у потомков взаимодействия аллельных и неаллельных генов, свойственных родителям.

Е. Л. Богданов в свое время считал, что выдающихся животных необходимо «уединить», то есть изолировать (применить к ним родственное спаривание), чтобы основа их ценной наследственности «не разбилась на куски». Путем продуманного подбора у животных необходимо накапливать нужные («полезные») гены, собирать их в цепочки: создавать определенные группы сцепления генов.

Английский сеттер, фото фотография собаки
Английский сеттер

Важно не проглядеть выдающихся животных. Для этого нужно создавать максимально благоприятные условия для полного развития ценных признаков. Правильное, например, выращивание и воспитание щенков, своевременная и умелая дрессировка и регулярная тренировка собак, всесторонняя их оценка позволяют выявить лучших в наследственном отношении животных.

В генетическом отношении однородный подбор в конечном счете ведет к возрастанию гомозиготности. Его применение, особенно неумелое, может сопровождаться проявлением и целого ряда недостатков. Среди них наиболее существенны следующие.
1. Понижение жизнеспособности получаемого потомства, односторонняя переразвитость его в каком-либо направлении, ослабление конституциональной крепости, снижение приспособленности и приспособляемости к внешним условиям, возрастание чувствительности к различным неблагоприятным воздействиям и в крайних случаях - вырождение.
2. Увеличение однообразия получаемых потомков, уменьшение изменчивости, возрастание консерватизма наследственности, вследствие чего затрудняется процесс дальнейшего совершенствования животных.
3. Закрепление у потомков одинаковых недостатков, присущих родителям.

Эти недостатки, а также то обстоятельство, что при применении однородного подбора очень трудно получить что-то действительно новое, заставляют прибегать к противоположному по своей сути типу подбора - разнородному, или гетерогенному. При разнородном подборе спариваемые самец и самка не сходны между собой, имеют разное выражение одних и тех же признаков.

Большой мюнстерлендер, фото фотография собаки
Большой мюнстерлендер

Основными правилами или формулами разнородного подбора являются «неравное с неравным уравнивается» и «худшее с лучшим улучшается». Разнородный подбор позволяет решать следующие задачи.

1. Получать животных с новыми качествами, которых не было у родителей; новые качества могут возникнуть за счет комбинации качеств исходных родительских форм и за счет сложного взаимодействия генов родителей в результате их перекомбинации. Следует считаться с тем, что новые качества могут быть лучше и хуже старых, родительских. Поэтому разнородный подбор необходимо сопровождать браковкой особей с неудовлетворительными качествами и отбором лучших.

2. Исправлять недостатки, присущие одному из родителей. Если у суки, например, задние конечности сближены в скакательных суставах, то к ней необходимо подбирать кобеля с безукоризненной постановкой задних конечностей. Нельзя исправлять одни недостатки другими, противоположными (например, подбором к вышеуказанной суке кобеля с бочкообразной постановкой конечностей). Недостатки исправляются только нормой. В противном случае отклонение от нормы у потомков может еще больше усилиться.

3. Получать животных промежуточного типа. Как правило, животные промежуточного типа бывают хуже исходных родительских форм. Помеси, например, борзой и таксы не способны ни быстро бегать, ни разрывать норы. Но в отдельных случаях, особенно в пользовательном животноводстве, животные промежуточного типа могут иметь высокую хозяйственную ценность. Из-за неминуемого расщепления признаков промежуточный тип трудно удержать в потомстве. Поэтому в племенном животноводстве разнородный подбор с этой целью применяется редко.

4. Повышать жизнеспособность приплода, его конституциональную крепость и продуктивность.

Разнородный подбор ведет к повышению гетерозиготности и часто сопровождается проявлением гетерозиса. Разнородный подбор обогащает наследственность. Наблюдается возрастание изменчивости, что дает богатый материал для отбора. У животных происходит ломка устоявшихся, сложившихся ранее корреляций, они перестраиваются, создаются новые соотношения между признаками.